Ученые впервые измерили плотность петель ДНК в живой клетке
Исследователи Сколтеха и Потсдамского университета разработали физическую модель, которая позволила впервые точно подсчитать, как плотно упакована ДНК внутри клеточного ядра.
Двухметровые хромосомы умещаются в крошечном клеточном ядре благодаря сложной системе складывания. Ключевую роль в этом играет белок когезин, который действует как молекулярный мотор и формирует петли ДНК. Ученые выяснили, что 60–70% всей ДНК в клетке находится внутри таких петель, а их плотность составляет около шести на миллион пар оснований. Модель также отделяет реальную структуру хромосом от искажений, которые вносит популярный экспериментальный метод Hi-C.
Теория проверена на более чем 30 наборах данных клеток человека и мыши. Результаты опубликованы в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences, а код для анализа данных выложен в открытый доступ.
